Das Deutsche Haus Kinshasa arbeitet eng mit den in der Demokratischen Republik Kongo ansässigen offiziellen deutschen Institutionen sowie mit bestimmten öffentlichen und privaten Einrichtungen in Deutschland zusammen, wobei es stets seinen Aufgaben und seinem Charakter als private zivilgesellschaftliche Organisation treu bleibt.
Zu seinen wichtigsten Partnern zählen: